多普勒彩超能够检查头部的一部分内容，通常成人颅骨比较厚，超声很难通过颅骨看到颅内组织的情况。所以，只能通过彩超，也就是经颅多普勒超声观察颅内大血管，对其基本情况作一个初步判断，对于脑组织内的病变，超声无法进行检查。一些婴幼儿可以选择超声检查颅脑组织，比如判断是否有脑积水，主要是因为婴幼儿颅骨组织比较薄，而且也可以通过囟门等对婴幼儿头部进行检查。
当成年患者有头部问题时，一般会选择CT、核磁共振进行检查。但两种检查方式也各有优越性，比如怀疑有脑出血时，可以首选CT。如果怀疑是脑梗死，通常会选择核磁共振，因为核磁共振对于早期脑梗死非常敏感。患者若有脑组织肿瘤，或者是颅内血管病变，一般也会选择做核磁共振检查，其对患者检查相对比较安全，而且对软组织的分辨率比较高，能够获得更多的影像学信息。