细菌性阴道炎是由于阴道内的菌群紊乱导致的一种混合性感染，主要是阴道内产生过氧化氢的乳酸杆菌减少，而其他的微生物大量繁殖，主要以加德纳菌等厌氧菌感染为主。典型的临床症状表现为阴道分泌物增多，伴有鱼腥味，性交以后加重，可伴有轻度的外阴瘙痒或者烧灼感，分泌物呈灰白色、均匀一致、稀薄，通常黏附在阴道壁，但是黏度比较低，容易将分泌物从阴道壁拭去，阴道黏膜没有充血的炎症表现。
细菌性阴道炎是由厌氧菌感染导致，随着微生物的大量繁殖，代谢产物可以使阴道分泌物发生生化改变，pH值升高，氨类物质、有机酸以及酶类增加。氨类物质可以使阴道分泌物增多，并有臭味，有机酸和酶可以破坏宿主的防御机制，溶解宫颈黏液，促进微生物进入生殖道引起炎症，所以细菌性阴道炎如果不进行治疗，很容易导致子宫内膜炎、盆腔炎以及子宫切除术后阴道顶端感染等。目前发病机制仍然不是很很清楚，可能和多个性伴侣、频繁的性交或者阴道灌洗等使阴道碱化有关，碱性环境不利于乳酸杆菌的黏附和生长，而有利于加德纳菌等厌氧菌的生长，从而引发细菌性阴道炎。