睾丸炎的治疗一般以抗生素为主，睾丸炎一般都是由于附睾炎蔓延累及形成睾丸的炎症，在刚开始发作时候症状比较严重，有明显的阴囊疼痛，睾丸、附睾肿大分界不清。
急性期可以给予静脉的抗生素，比如三代头孢或者喹诺酮类抗生素，一般输液5-7天，当急性期症状得到控制以后再改用口服抗生素，比如输液一周左右，然后改用口服抗生素2-4周。口服抗生素可以给予头孢类、喹诺酮类、四环素类等。一般等症状完全控制好转以后才认为是治愈的，有一些人炎症好转以后，在附睾可能会遗留有一些硬结，长期消除不了，多数的附睾睾丸炎通过抗生素的治疗都可以痊愈。