患者肛瘘症状可通过手术治疗，手术时间需要5-10分钟左右，但具体时间不能确定，较难做的手术需要30分钟左右。肛瘘手术包括单纯性肛瘘手术，瘘管较直手术比较简单的，在进行手术时只要是将漏管切开就可以，多数患者需要5-10分钟左右时间手术即可完成。
如果患者漏管弯曲内口较多，在治疗时会复杂，手术时会需要沿着内口切除肛瘘，将肛瘘管到行至内口，此种手术较为复杂，在遇到内口较多时需要切开挂线并配合治疗，手术时间大约需要30分钟左右。
手术时具体时间并不能固定，主要根据手术中遇到特定的情况，手术后患者总体需要住院2-3天时间，手术后一天需要进行检查是否出现出血。