吃了避孕药会导致内分泌失调，需要看吃的避孕药的成分。目前市面上比较多见的是口服的短效避孕药以及紧急避孕药，口服的短效避孕药在正常情况下，并不会引起女性的内分泌紊乱，尤其性腺轴分泌的激素紊乱，因为口服的短效避孕药，所应用的机理就是利用外界的一些激素水平，调控平时的月经周期。因此在外用激素的条件下，卵巢基本处于休息的状态，当停用了短效避孕药之后，卵巢反而会有反调型的功能恢复，所以对平时内分泌比较紊乱的状态，尤其是多囊卵巢综合征这类的病人，常常利用口服短效避孕药来进行调经，绝大多数病人停用避孕药之后，内分泌的功能和月经的周期反而会比服药之前更加规律。
当然，也有一部分女性服用避孕药之后出现内分泌失调，绝大多数是应用了紧急避孕药，因为紧急避孕药是应用了大量的孕激素的成分，在体内突然大量的摄入激素成分之后，会有可能造成一过性的激素水平紊乱，在激素水平完全代谢之前，体内的子宫内膜等会受到相应的影响，因而尤其会出现不规则的出血，甚至伴随有躯体上的症状。随着药物的逐渐被代谢干净，副反应也会逐渐的消失。如果偶尔的吃了紧急避孕药造成内分泌紊乱，继而发生阴道出血，绝大多数情况下不用处理，静静的观察大约2-3周，大部分的病人都能够恢复正常。