包茎由于包皮不能上翻、龟头不能外露，常常会在包皮表面形成包皮垢。
而包皮垢在包皮和冠状沟之间积存可引起细菌大量繁殖，同时包皮垢刺激龟头和阴茎皮肤会诱发阴茎癌，包皮下积存的病原微生物还会沿尿道外口逆行感染，引起尿道炎和前列腺炎。
包皮过长而包皮可以外翻，但由于包皮过长覆盖龟头导致包皮、龟头发生炎症和包皮垢，而包皮垢刺激同样可以引起龟头炎和龟头癌，所以包皮过长和包茎的危害一样严重。