肥厚性心肌病是一种常染色体显性遗传性疾病，60%-70%为家族遗传性，家族性的病例和散发病例具有同样的致病基因突变，目前已经证实有14个基因突变与肥厚型心肌病的发病有关。
因此肥厚性心肌病的主要病因是遗传因素，或者是基因染色体的缺陷。
而高血压等原因导致的心肌肥厚，不是肥厚性心肌病发生的病因，而为心肌的一种代偿性改变。
如果确诊肥厚性心肌病，还需要积极在专业心血管内科医生帮助下治疗，以免影响心脏正常运作。