重症肌无力是比较特殊的疾病，其治疗方法包括药物治疗、手术治疗和特殊治疗，主要是根据重症肌无力的情况来讲。如果处在急性期，患者以药物的保守治疗为主，药物治疗推荐使用胆碱酯酶抑制剂，可以达到很好的效果。
除此之外还有免疫抑制的药物，比如激素也能达到非常好的治疗效果。针对比较危重的患者可以静脉注射丙种球蛋白，乃至于血浆置换的手段都能达到很好的治疗效果。
手术治疗主要针对胸腺增生或者有胸腺瘤的重症肌无力患者，应尽早接受胸腺摘除手术。胸腺摘除手术，现在采用微创手段，完全通过胸腔镜来完成，创伤非常小，也能完整切除胸腺及其周围的增生脂肪组织，达到改善症状和根治重症肌无力的效果。