先天性脑积水主要针对病因，采取有效的治疗方法。常用的治疗方法有几种：第一种治疗策略，是减少脑脊液分泌的手术，包括脉络丛切除手术和内镜下脉络丛电灼术。第二种治疗策略，是脑脊液分流术，是通过分流管将脑室内多余的脑脊液分流到其它腔室，最常用的是脑室-腹腔分流术。第三种治疗策略，就是内镜治疗，包括第三脑室造瘘术等，还有内镜下脉络丛电灼术，这是内镜手术常用的两种方法。