扁桃体结石有时可以自己脱落，但是大部分情况下不会自己脱落，因为扁桃体结石是扁桃体窝内储存有分泌物或食物的残渣，在临床上比较常见。
食物残渣可以进入扁桃体腺窝内，腺窝外面大、里面小，所以很多食物进去以后不容易出来，这样长期以来形成一种黄白色的分泌物，形成扁桃体的结石。
个别情况下也可以通过口嚼东西以及吞咽动作使部分的结石脱落出来，但是大部分情况下不容易自己脱落，需要进行冲洗，才可以把结石冲洗出来。