肛门疼痛在临床上诊断起来比较困难，因为引起肛门疼痛的疾病太多。第一、首先考虑肛裂。肛裂疼痛一般是在便秘后出现，是一种撕裂样的疼痛，同时伴有便血，鲜血，出血量比较少。第二、血栓性外痔，这是临床上最为常见的问题。肛门口发现黑色的肿物，呈黑色球形，疼痛比较剧烈，持续钝疼，不手术疼痛很难缓解。第三、肛周脓肿，肛周脓肿是肛门口一个红、肿、热、痛的包块，边缘不规则，伴有局部发热、全身乏力的情况。第四、肛周湿疹，肛周湿疹可以见肛门口及其周围有一些小的裂口，也可以引起肛门口疼痛的情况。第五、内痔脱出嵌顿发生血栓，也可以引起肛门口的疼痛。还有一些功能性的肛门口疼痛，患者有疼痛的症状，有的时候还比较重。在临床上分为急性的肛门口疼痛和慢性的肛门口疼痛，就是做任何的检查，没有发现临床的异常情况。