月经期小腹痛，多数是由于痛经所导致。痛经分为原发性痛经和继发性痛经，其中原发性痛经是由于体内前列腺素分泌异常增多，以及子宫平滑肌对于前列腺素的敏感性增加所导致。一般没有明确的器质性病变，其中疼痛程度也因人而异。有些人仅有小腹部的不适，此时不需要进行特殊治疗，可进行休息，多数在2-3天以后可以缓解。而对于严重的痛经患者，影响生活质量，需要给予解痉镇痛的药物。对于没有生育要求的年轻女性，也可以选择口服避孕药来抑制排卵，从而缓解疼痛程度。
对于继发性痛经，月经期的小腹疼痛多数是由于子宫内膜异位症、子宫腺肌症或者子宫肌瘤所导致，这些情况需要根据具体的病因进行治疗。对于子宫内膜异位症和子宫腺肌症，治疗也可以选择口服避孕药，或者放置宫内曼月乐环，而起到止痛解痉的作用。另外，对于子宫肌瘤增大比较明显者，也可以选择手术治疗。对于围绝经期女性痛经进行性加重，以及子宫腺肌症、子宫体积增大，也可以选择手术切除来缓解痛经。