支气管扩张的病因主要是分为先天性因素以及继发因素，先天的因素比如先天的软骨发育不全或者先天的巨大的气管支气管征，还有马凡氏综合征都会导致先天因素，导致支气管扩张的发生。继发的因素主要是气道防御功能的下降、纤毛摆动的能力的下降、异常，还有继发的感染，通常会继发于结核之后，以及误吸，此外免疫功能异常也是气管扩张的常见的病因。