支原体和衣原体的主要区别就是这两种病原体属于不同的病原微生物。这两种病原体进入机体以后，可以引起一系列的表现，可以导致一些疾病的发生。如患者感染支原体和衣原体以后，可以引起支原体肺炎或衣原体肺炎。另外，可以出现沙眼衣原体结膜炎的表现。同时大人如果感染可以出现阴道炎和尿道炎的表现。对于这些病原体所引起的感染，是需要进行积极的治疗的。通常首选大环内酯类药物，如罗红霉素、阿奇霉素，来进行积极的治疗。一般通过这些药物的治疗，这些病原体就可以得到消灭，疾病就可以得到控制，身体逐渐恢复健康。