有极个别男子的阴茎太短，确实会影响性生活。第一种称为小阴茎，多见于15-25岁的青年，常伴有第二性征发育不良，例如睾丸太小、没有胡须、阴毛、腋毛、喉部较平等，这是由于体内缺乏雄激素造成的。雄激素缺乏，有先天性和后天性两类。先天性缺乏是在孕期内胚胎阶段已发生，在出生后会被发现。后天性缺乏是由于染色体或内分泌系统障碍所致，往往到青春期，阴茎不能发育，迟迟未出现第二性征时，才引起注意。但这类患者却又要在青春期内治疗才有效果。在20岁前后才发现性发育不良而求治，此时全身发育已成熟定型，再让阴茎长大较困难。