心肌炎的严重程度不同，而生存率也有所不同。大多数病毒性心肌炎一般预后比较良好。患者治愈后对远期的生存率没有任何影响，但是一些严重的心肌炎、暴发性重症心肌炎，近期死亡率比较高。
如果心肌炎患者合并三度房室传导阻滞，合并心力衰竭，合并低血压休克等严重的并发症，则患者容易在住院期间死亡。
即使存活下来，以后也可能遗留反复憋喘等心衰症状，远期预后不是很理想，平时只能按时服药，注意生活方式干预，减轻症状，尽量延长寿命。