肾囊肿锻炼后一般是不会消失的。肾囊肿可分为先天性的肾囊肿和后天性的肾囊肿两种类型。先天性的肾囊肿，是一种遗传性的疾病，因此并不会随着锻炼而消失。而后天性的肾囊肿，一般来说也不会随着锻炼消失，有的患者可能会稳定在一定的大小，也有的患者会越长越大，肾囊肿如果锻炼后出现消失，有可能是因为剧烈运动以后导致肾囊肿破裂。对于后天性的肾囊肿来说，尤其是单个的肾囊肿，它并不影响肾脏的功能。因此，得了肾囊肿以后并不需要特殊的治疗，除非囊肿大于五公分产生了压迫症状，比如患者出现了腰痛、腰酸等症状，或者囊肿特别巨大，超过十公分以上则需要积极的进行治疗。