异位妊娠的手术指征是有大量的内出血，伴有休克等症状时，需要在紧急备血且纠正休克的同时，尽快行开腹手术，抢救患者的生命。另外，如果异位妊娠发现妊娠囊组织比较大，并且伴有胎心和胎芽组织，HCG水平大于2000U/L以上，无法行保守治疗时，需要采用手术治疗的方法。另外，对于经过药物保守治疗，HCG升高比较快速或者下降不理想时，也是采用手术治疗的一种适应症。
异位妊娠的手术治疗包括输卵管的切除手术，以及保留输卵管的手术。根据患者生命体征的情况，来选择腹腔镜或者开腹的手术进行治疗。对于生命体征平稳的患者，可以采用腹腔镜的手术来治疗，该手术具有微创性，术后恢复快。保守性的输卵管手术包括输卵管造口术、输卵管切开术，以及输卵管的伞部挤压手术。