玫瑰糠疹的病因目前并不清楚，但是有季节性发作，而且有一定的自限性，很少会出现复发。从临床观察到的现象发现，玫瑰糠疹大多数和抵抗力下降以及病毒感染有关系，有相关研究显示玫瑰糠疹和科萨奇B组病毒感染有直接相关性，特异性抗体的阳性率明显高于健康对照组。
综合试验以及病毒分离相关试验都证实患者体内有科萨奇B组病毒的感染，所以支持玫瑰糠疹和病毒感染的密切相关性。此外，还有未经证实的、可能的感染相关的因素，比如一部分的真菌、细菌，甚至螺旋体，其他的微生物也有可能引起玫瑰糠疹。