直肠腺癌的分期，通常是按照Dukes的分期方式进行分期。
主要包括DukesA期，是指癌肿没有穿出肌层，没有淋巴结的转移，DukesB期，指的是癌肿已穿出深肌层，并侵入到浆膜层、浆膜外，或直肠周围的组织，但仍然没有淋巴结转移。
DukesC期，指的是癌灶伴有淋巴结转移，又可根据淋巴结转移的部位，分为C1期和C2期，其中C1期指的是癌肿临近淋巴结转移，包括肠旁及肠系膜淋巴结，C2期指的是癌肿伴有，肠系膜动脉结扎处淋巴结转移。
DukesD期，指的是癌肿伴有远处器官的转移，或因局部广泛浸润、淋巴结广泛转移切除术后，无法治愈或无法切除者。