卵巢巧克力囊肿破裂会引起腹膜的刺激症状，引起急腹症，多数患者会因腹痛急诊入院，B超检测盆腹腔内大量积液，行急诊的手术治疗。术中探查盆腹腔内，可见大量的巧克力样液体，这种液体多数会引起腹膜刺激症状以及炎症反应，导致腹痛剧烈。
因此卵巢巧克力囊肿一旦破裂，一定要进行急诊的手术治疗，避免因破裂时间较久，腹膜炎症刺激引起盆腹腔的广泛粘连。另外，卵巢巧克力囊肿破裂以后，如果破裂处有大血管，可能会引起大出血，此时也是引起急腹症的临床表现，需要急诊行手术治疗。