肺移植后并发症有早期的并发症，还有晚期的并发症。手术后出现的并发症包括出血、气管吻合口的裂开等等，都是术后早期出现的并发症，可能会影响到病人的短期的生存。肺移植的晚期的并发症主要有排斥反应，包括急性的排斥反应和慢性的排斥反应，还有感染等等，这些都会影响到病人的长期生存。