对于左氧氟沙星的副作用来说，也就是喹诺酮类药物的副作用。一般服用此类药物的患者建议18岁以上的成年人为主，18岁以下患者禁止服用，因为服用有可能影响患者神经、智力的发育。部分患者服用左氧氟沙星之后会出现胃肠道反应，如恶心、呕吐，部分患者可以形成菌群失调性腹泻，多见于长期服用药物的患者。
另外，有一种比较特殊的并发症，如果长期服用左氧氟沙星类药物，有可能增加患者跟腱断裂的几率，所以服用此类药物一般建议不要超过10天。如果需要持续服用，建议间隔一段时间之后再服用或者用其他药物代替。如果患者是感染并能取得感染灶脓液或者体液，建议尽量做细菌培养和药敏试验，根据药敏试验结果选取其他类的抗生素进行服用或者静脉输注。