要根据具体的情况来分。像阵发性房颤，如果在房颤的发作间歇期，也就是心率正常的情况下，可以采用某些抗心律失常的药物来预防房颤的反复发作。如果没有器质性心脏病，可以选用心律平、美西律、胺碘酮等等药物。如果患者有器质性的心脏病，一般以胺碘酮为主。
另外血管紧张素受体拮抗剂，作为一种降压药物也可以起到一定的减少房颤发作的作用。对于持续性房颤或者是慢性房颤，通常是以控制心室率为主，不让它太快，可以应用β受体阻断剂，比如氨酰心安或者是倍他乐克，或者是非二氢吡啶类钙离子拮抗剂，也就是合心爽或者是合贝爽来控制心率。
此外还可以服用地高辛作为控制心率的药物。除了这些药物，如果患者是一个血栓高风险的情况，还要应用抗凝药物，比如像华法林或者是新型的口服抗凝药来减少血栓的发生。