心房扑动大多数为阵发性，呈现出突然发作、突然终止的特点。每次发作可以持续数秒钟、数小时、数天，如果持续时间超过两周，即为持续性的发作，又可以称之为慢性的心房扑动。心房扑动有没有症状主要取决于是否存在基础心脏病以及心室率的变化。
心室率的快慢与心房扑动的房室传导比例有关系，当房室传导为3:1到4:1的时候，心房扑动的心室率接近正常，对血流动力学的影响比较小，症状可以没有或者是很轻微。可能会出现轻微的心悸、胸闷等情况。
如果当房室传导为2:1甚至是1:1的时候，心室率可以超过150到300次，血流动力学可以明显的受累，患者可以出现心悸、胸闷、头晕、眩晕、恐惧、呼吸困难、精神不安等等，可以诱发心绞痛或者是脑动脉供血不足。特别是在老年的患者，尤其是在初发的时候以及原有心脏病比较严重的患者，心室率增加更明显，可以诱发和加重心力衰竭。