男性不育的治疗方法主要包括以下三大类：第一、是药物治疗，第二、手术治疗，第三、辅助生殖技术的治疗。
对于轻中度的少弱畸形精子症，可以采用药物治疗的方法，药物治疗的种类对于西药来讲，主要包括激素类的药物、抗氧化剂的治疗，同时中医药在治疗男性不育方面可以采用补肾益精、活血化瘀、清热利湿的治法，可以明显的改善精液的质量。
手术治疗适用于患者有明显的精索静脉曲张导致的精液质量下降、梗阻性的无精子症等。对于梗阻性的无精子症，可以采用输精管的吻合或者是显微外科的输精管附睾吻合，以及经尿道的输精管囊肿的切开，包括输精管开口的切开，都可以起到改善精液质量的作用。
对于部分的睾丸原性的无精子症患者，也可以采用显微外科的取精，为做试管婴儿提供精子的准备。近些年来辅助生殖技术得到了迅速的发展，我们可以采用宫腔内的人工授精，包括一代或者是二代的试管婴儿，都可以治疗男性不育。