急性肾盂肾炎最常做的实验室检查即尿液检查，尿常规可提示白细胞、尿血尿和蛋白尿，同时还可以做白细胞排泄率，要准确的留取三个小时的尿液进行尿白细胞的计数。
同时还可以做中段尿细菌培养，或者是尿液涂片细菌检查，还可以完善硝酸盐还原试验，由于大肠埃希菌等革兰氏阴杆菌可以使尿液内的硝酸盐还原于亚硝酸盐。
其他还可以出现肾小管功能异常，表现为尿比重或尿渗透压下降。除尿液检查外还可以做血液检查，血常规中可提示白细胞升高、中性粒细胞增多、核左移、血沉可增快。