根据结石的大小不同，输尿管结石治疗的方法也不同。因为输尿管管腔比较细，所以结石在排出过程中，容易卡在输尿管内，不容易排出。对于直径小于6mm的结石，而且结石比较光滑，通常通过药物排石可以将结石排出。
对于大于6mm的结石，需要行体外冲击波碎石治疗。体外冲击波碎石的目的是将结石碎成小块，小于6mm的小结石，通过药物来进行排石。
在药物排石的过程中，还需要注意多饮水，适当的活动，这样通过尿液向下冲结石，利用结石的重力作用向下排石，再加上药物对于输尿管的松弛作用，有利于整个结石的排出。