可将四环素作为首选药的疾病主要有以下几种：
1、立克次氏体类病原感染：比如斑疹伤寒、恙虫病、Q热、巴尔通体引起的猫抓热、人粒细胞无形体感染等，一般首选四环素类药物，可以应用盐酸多西环素或盐酸米诺环素。
2、布鲁菌病感染：常首选四环素类药物治疗，一般不单独应用，需要与利福平联合治疗，而且疗程相对较长，至少在六周。如果患者为反复或慢性的布鲁菌病感染，疗程需要延长。
3、生殖道的支原体、衣原体感染：有时大环内酯类药物出现耐药的几率较高，也可以首选四环素类药物进行治疗，可以应用盐酸米诺环素或盐酸多西环素。对于泌尿生殖道的支原体以及衣原体感染，病情容易反复，疗程不够者容易导致病情复发，故需要应用足够疗程。