枕骨大孔的位置位于颈椎和颅骨相接的部位，此处属于颅底的一个结构，是枕骨的一部分。在枕骨的下方正中，有一个比较大的孔，称作枕骨大孔。在枕骨大孔的左右两边，有枕骨髁。枕骨通过枕骨髁跟第1颈椎的两个侧块相连接，枕骨大孔直接跟颈椎的椎管相连接。枕骨大孔内部是脑干的最下端，再往下的部位是颈髓的起始段，所以枕骨大孔是大脑跟脊髓相交的界限和通道。枕骨大孔这个部位由于是一个骨性通道，在大脑内部由于脑出血、肿瘤类的疾病，导致大脑内部压力过高，也就是出现颅高压的时候，可能导致相关的组织向下突出。这个时候会使脑干在这个部位受压，也就是出现小脑扁桃体疝的情况。此时可能会导致患者出现严重的头部疼痛，甚至有可能使患者马上出现呼吸、心跳骤停的情况。