十二指肠球部溃疡也有癌变的可能，但是癌变的几率非常小，大概在5%或者小于5%。如果出现恶变，病人会有明显的右上腹疼痛，进行性的加重，伴有食欲下降和体重减轻，后期还会出现明显贫血。而大多数情况下都是良性病变，经过系统的抗溃疡治疗，症状能够逐渐的好转，并且在中青年患者人群发生率是非常高的。
十二指肠球部的溃疡，很容易并发穿孔、出血、瘢痕性幽门梗阻。而幽门梗阻是进行手术治疗的绝对指征，单纯的穿孔、出血，可以经过保守的治疗办法控制。大出血的病人，有明显的低血压、休克的时候，需要紧急地进行手术将溃疡切除。