肛门内部出现疼痛，在肛肠科是一个常见的临床症状，不是一个独立的疾病，是由很多的疾病而引起。常见的疾病有肛窦炎、肛周脓肿、内痔的血栓、直肠黏膜内脱垂，还有肛裂、肛瘘内部的感染都可以出现肛门内部疼痛的问题。还有常见的直肠炎、直肠癌也可以引起肛门内部的疼痛。要想明确诊断，就需要做一个肛门镜检查，就可以明确是哪一种疾病。明确这种疾病以后，再做进一步的治疗。有些情况下很难比较诊断，需要做磁共振检查，才可以明确肛门内部疼痛的原因。