卵巢巧克力囊肿术后可以皮下注射亮丙瑞林或者戈舍瑞林，3-6个月的时间可以使体内残留的异位的病灶坏死，降低复发率，甚至不复发的。但如果有生育要求的女性也可以在术后3个月积极备孕，如果怀孕了，怀孕期间不来月经，则残留的异位病灶也有可能坏死、消失。患有卵巢巧克力囊肿的患者，主要的表现为进行性加重的痛经，而且囊肿会导致盆腔环境的改变而出现粘连，甚至影响怀孕。所以存在巧克力囊肿一经发现建议积极手术治疗，可以采取腹腔镜微创手术的方式，对身体损害性小。