儿童抽动症的治疗关键是心理行为的治疗，包括生活起居的调整、心理咨询的干预、行为的干预训练、暴露的预防，通过治疗，减少患儿的焦虑、抑郁情绪，消除发作的诱因，这些诱因如疲劳、紧张、过度兴奋等。
药物治疗的目的主要是控制症状，对于发作比较频繁，出现全面性抽动障碍，影响日常生活的，可进行药物治疗，我们国家首选硫必利，因为其不良反应较小，硫必利是多巴胺受体阻滞剂，5-10mg/kg每天，每日分2次，或者3次口服，最大量不超过600mg/d。
国外首选是氟哌啶醇，因其最有效，氟哌啶醇开始是0.05mg/kg每天，以后渐增至0.075mg/kg每天，每日分2次，或者3次口服。同时需要加等量的苯海索，以防止氟哌啶醇的锥体外系的不良反应。其他的对于难治性的抽动障碍选用氯硝西泮、丙戊酸，或者是托吡酯等药物治疗。