怀孕初期流褐色分泌物，首先考虑是先兆流产的可能性比较大，应该去医院查妇科彩超，看胚胎的发育情况。如果彩超看到宫腔内孕囊回声，胎心搏动良好，出现褐色分泌物，如果打算要宝宝，应该给予药物保胎治疗，一般常用的是黄体酮胶囊、黄体酮注射液或者地屈孕酮片，效果都比较好。
同时在保胎的过程中要注意休息，避免过度劳累，如果出现阴道流血增多，要及时去医院就诊，如果做彩超没有看到胎心搏动，要警惕是稽留流产，一般要再复查彩超，直到看到胎心搏动为止。
如果过一周复查彩超，仍然没有看到胎心搏动，孕囊大小甚至会有所减小，应该确诊是稽留流产，这种情况应该住院给予药物流产治疗。