治疗胃肠炎的中成药有补脾益肠丸、枫寥肠胃康胶囊和颗粒、摩罗丹、人参健脾丸、附子理中丸等，三九胃泰、胃素颗粒、胃服康、摩罗丹、香砂养胃丸等也具有一定的疗效。
治疗胃肠炎建议一定要进行病因治疗，一定要找出导致胃肠炎的原因，比如进食不当，油腻、寒凉、刺激性食物一定要注意戒除。
对于慢性胃肠炎的患者建议最好是检查肠镜，排除息肉或者溃疡性结肠炎，克罗恩病等相关的其他疾病，如果急性肠胃炎或者胃肠炎的患者最好是检查血常规、大便常规，结合情况以及有无感染进行综合性的治疗。