尿路感染可以应用头孢克肟进行治疗，尿路感染尤其是下尿路感染，目前治疗主要用药是抗菌素，临床上可以根据尿培养和药敏试验结果选择敏感抗生素，推荐经验性应用药物包括磷霉素、氨丁三醇、匹美西林、呋喃妥因、喹诺酮类以及第二代或第三代头孢菌素。
头孢克肟属于头孢类抗生素，通常对于女性患者，治疗的疗程是单剂疗法或者三日短程疗法。对于男性患者，考虑到感染复杂性，一般推荐七天疗法。同时可以应用一些缓解症状药物，如黄酮哌酯类药物，也可以通过碱化尿液，减轻膀胱刺激征状。