健脾丸属于中成药类非处方药，按照说明书推荐的剂量和疗程使用是比较安全的，不良反应较少，偶见患者出现皮疹、瘙痒等过敏反应，对此药过敏者禁用。此药属于补益类的药物，具有健脾开胃的作用，适宜饭前服用。
偶见患者出现恶心、 呕吐 、食欲不振、 腹痛等胃肠道反应， 饭后服用会减轻药物对胃肠道的刺激，减少药物不良反应的发生率 ，特别是对于平素脾胃功能不好的患者，饭后服用可以有效的起到保护胃肠道黏膜的作用。用药前需要仔细阅读药品说明书，做到对症合理使用，此药不宜长期服用，服药三天症状无改善，或者出现其他症状时应立即停用，并到医院就诊。