男性尿路感染的治疗包括两个方面，针对病原体的治疗和对症治疗，根据感染病原体不同，通常采取不同的药物治疗。对于一般的尿路感染，通常是大肠杆菌等革兰氏阴性菌感染引起。使用喹诺酮类药物或头孢类药物，效果比较好。淋球菌感染而引起的尿路感染，通常需要选用头孢类药物和四环素类药物，由衣原体、支原体感染而引起的非淋菌性尿道炎，通常需要选用喹诺酮类药物、四环素类药物或者红霉素类药物。由滴虫引起的尿路感染，通常需要选择抗滴虫药物如替硝唑、甲硝唑。对于霉菌引起的尿路感染，需要针对真菌进行治疗，比如伊曲康唑等。