临床上乙肝病毒感染者应用口服恩替卡韦进行抗病毒治疗，进而追求转阴的结果，往往是以下两种情况：
一、65%-90%：乙肝病毒DNA的转阴，也称为功能性治愈，也就是乙肝病毒DNA由原来的高载量转为检测值以下，DNA转阴概率非常高，大三阳可以达到90%左右，小三阳可以达到65%左右。
二、2%以下：乙肝表面抗原转阴，也就是临床治愈，这种概率非常低，大三阳临床治愈概率2%，小三阳临床治愈概率几乎为0。
虽然乙肝表面抗原转阴的临床治愈几乎不可及，但乙肝病毒DNA的转阴会大大降低乙肝病毒感染者肝硬化和肝癌的发生概率，这才是目前临床应用恩替卡韦抗病毒治疗的最主要目标。需要注意的是，应用恩替卡韦抗病毒治疗，千万别擅自停药，停药需要在专科医生指导下进行，否则会导致病毒复发，少数人会发生重型肝炎而失去生命。