阴囊湿疹的用药需要根据皮疹的情况来决定。如果湿疹时间比较短，表面没有破皮渗液，可以选择外用，稍微弱效一点的糖皮质激素药膏，或者不含激素的他克莫司软膏、吡美莫司乳膏来治疗。
如果有破皮渗液，一般可以选择像3%的硼酸溶液来湿敷，可以把干，但皮肤干燥以后可以考虑使用上述的药膏来治疗。如果是湿疹时间比较长，往往会因为反复搔抓导致局部皮肤增厚。建议使用他克莫司软膏或者吡美莫司乳膏，相对可以长期使用，安全性比较好，此时也建议配合一些舒缓滋润，或者保湿的护肤品来保护。
瘙痒明显的时候，也可以外用含有薄荷或者樟脑的药膏或者药水来止痒。如果局部出现皮肤感染，也要使用抗生素进行治疗。外用的抗生素像红霉素软膏、莫匹罗星软膏或者夫西地酸乳膏等等。