鹅口疮长期不好，首先会刺激口腔黏膜引起疼痛。如果在小孩，一般会出现哭闹，不愿意进食。
如果用器械去除鹅口疮的白色物质，基底的黏膜会充血，触碰的时候疼痛。所以，鹅口疮会引起黏膜炎症而出现疼痛，给病人带来不适。
如果是成年人，目前也有认为长期的白色念珠菌感染，可能和口腔黏膜的癌变有关。
以往认为炎症不能癌变，但是目前医学发展看来，一些慢性的炎症，包括白色念珠菌感染，都可以诱发癌变。
所以得了鹅口疮，应该尽早进行治疗，可以用小苏打水漱口，改变口腔酸碱环境，抑制白色念珠菌的生长，也可以应用抗真菌的药物来彻底治疗。