对于新生儿中度贫血的治疗，首先是要看引起贫血的原发病，要治疗原发病才能从根本上解决中度贫血。一般中度贫血不会影响呼吸和血氧饱和度，除非是早产儿，有可能会发生呼吸暂停或者是低氧血症。对于解决的办法，必要的时候除了针对病因治疗之外，可以给予适当的输血。尤其是针对病因的治疗，是解决新生儿中度贫血最主要的办法。
如果是溶血导致的新生儿中度贫血，可以经过换血来换掉体内的抗体，从而减轻贫血的程度。如果是失血性的贫血，要针对失血的部位，如原发病是消化道出血，还是因为凝血机制异常等导致的出血进行治疗，才能解决新生儿贫血的问题。