肠虫清的副作用很小，对人的危害不是太大，极少数病人服用肠虫清之后，会有胃肠道不适、皮疹、头痛、发烧，一般停药后可以自行缓解。
肠虫清主要是用来治疗蛔虫病，和绦虫病、鞭虫病等人体寄生虫的一种药物，其主要成分是阿苯达唑片。肠虫清极少数在肠道内吸收，大概95%左右不被吸收，是在肠道内直接与虫体和虫卵相作用，导致寄生虫溶解或者死亡。所以肠虫清的副作用并不是很大，对人体的危害也不是太大。
但是要注意在服用肠虫清的过程，如果对阿苯达唑过敏，则需要避免使用此类药物。同时在服药过程中要注意观察。是否有恶心、呕吐、腹泻等胃肠道反应，一般停药后这些反应就会明显地消退。