甲状腺过氧化物酶是存在于甲状腺的细胞的微粒体当中，是微粒体的一个主要成分。甲状腺过氧化物酶是一种潜在的自身抗原，从细胞内向细胞外泄漏时，可刺激机体产生抗甲状腺过氧化物酶的抗体。
抗甲状腺过氧化物酶抗体测定，有助于诊断自身免疫性疾病，90%以上的慢性淋巴细胞性甲状腺炎的患者具有高浓度的抗甲状腺过氧化物酶抗体。70%的格瑞斯疾病患者，甲状腺过氧化物酶抗体浓度可以升高。
甲状腺过氧化物酶抗体浓度可以升高，它的正常值一般小于30 IU/ml，抗甲状腺过氧化物酶抗体阳性时，同时要测定甲状腺的功能，来诊断是否有慢性淋巴细胞性甲状腺炎或者格瑞斯病。