尖锐湿疣的手术，具体讲可以分为常规外科手术，还有激光手术治疗。如果是比较大的尖锐湿疣疣体，可以做局部外科式手术切除，通常就是局部先清洁、消毒和铺巾，然后做常规局部浸润麻醉，再使用手术刀沿着疣体的基底部将其切除，中间随时止血、缝合，最终缝合皮损，这就是手术治疗的基本流程。
更多的是采取激光手术方式，这个相对更加方便，一半是局部消毒、浸润麻醉之后，使用二氧化碳激光，沿着疣体的边缘和基底部逐一灼烧，将尖锐湿疣的疣体气化。局部如果出血，也可以通过激光凝固止血，术后局部再次消毒，或者是预防性的使用抗感染的药物，通常需要两周左右的时间，局部创面才能恢复愈合。