肛周脓肿手术后正常情况下是不允许抽烟的，因为肛周脓肿有时会伴有比较明显的感染，包括局部感染甚至周身感染、发热的情况。如果此时抽烟，可能会加重患者机体免疫力的降低，容易造成全身继发感染的可能性。
同时在术后抽烟，可以导致机体免疫力低下的同时，不利于肛周脓肿术后的恢复。有时肛周脓肿手术比较严重时会采用全麻，这种情况下术后对呼吸道的管理更为严格，容易造成坠积性肺炎或者继发性肺炎。
此时如果抽烟的情况下会加重肺部症状，以及引起比较严重的并发症。因此，肛周脓肿术后尽量要卧床休息，适当的活动以及减少抽烟甚至不要抽烟，更有利于肛周脓肿术后的恢复，有利于肛周脓肿早期治愈。