慢性咽喉炎的微创手术，有些机构可能会选择激光进行咽部淋巴滤泡的烧灼切除的治疗。慢性咽喉炎的治疗并不是以手术为主，慢性咽喉炎的原因通常是因为慢性的不良生活习惯，慢性疾病的刺激而引起，所以治疗应该针对于病因的治疗，比如长期的烟酒刺激、用嗓过度，或者辛辣、刺激的饮食，都有可能会导致慢性咽喉炎的反复发作。
还有邻近器官的疾病，比如说慢性的鼻炎、鼻窦炎、扁桃体炎，或者是有胃食道反流等疾病，也会诱发慢性咽炎的反复发作。所以针对这些诱因的治疗才是主要的治疗，对于急性发作期主要也是以药物治疗为主，并不需要去进行手术的干预，手术并不能彻底解决问题。