牙痛时杀神经是在局部麻醉下治疗，这样感觉不到疼痛，把牙洞钻开，然后把里面已经发炎的神经取出来，同时把神经走的管道，即根管，进行清理、消毒、扩大、成形，再封药消毒，最后是根管充填，也就是把之前神经走的管道进行填充。
神经被取出来后，这个管道就空了，要把这个管道进行清理、消毒、杀菌，完成后在这个管道里面填上牙胶，再把它填实了，治疗就算做完了，这就是一个完整的牙痛杀神经的过程，也叫根管治疗。