目前中药并不能够起到降低乙肝病毒复制的效果，如果需要抗病毒治疗，建议采用标准的西药治疗，推荐的药物包括恩替卡韦及替诺福韦，能够有效的抑制乙肝病毒的复制，延缓肝纤维化、肝硬化的发展，并且降低肝癌的发生概率。中药对于乙肝的治疗主要是针对肝功能的异常，如果出现转氨酶的升高，可以口服垂盆草进行治疗。
乙肝出现急性发作需要进行乙肝病毒DNA的检测，如果出现肝功能的明显异常，乙肝病毒DNA的升高就需要口服抗病毒治疗，疗程不明，一般大部分病人都需要3-5年，乙肝表面抗原转阴才能够停药。